Первые письменные упоминания о храме относятся ко второй половине XVI века. В 1568 году владелец Ружан Василий Тышкевич жертвует на церковные нужды землю в д. Байки, а его супруга в 1572 году – дом с землей для проживания приходского священника.
Строительство кирпичного храма было начато в 1762 году Христиной Масальской (из рода Сапегов), которое завершилось в 1779 году.
В 1784-1788 гг. архитектор Ян Самуэль Беккер построил при церкви каменное двухэтажное здание. В указанное время этот же архитектор реконструировал храм, придав ему черты барокко с элементами классицизма.
Храм и церковно-приходской дом составляют единый величественный архитектурный комплекс. Церковь украшена слоистыми пилястрами и развитыми карнизами. В храме имеются росписи «Преображение Господне» и «Святые евангелисты». В своде апсиды размещена роспись «Господь Саваоф», на северной и южной стенах (над иконостасом) в медальонах – изображения святых апостолов Петра и Павла. На колокольне находятся три колокола.
Храм в советское время не закрывался.
Одной из особо почитаемых святынь прихода является местночтимая Ружанская икона Божией Матери. Об одном чуде, связанном с почитаемым образом, свидетельствует помещенная под иконой старинная табличка с надписью «Храм сей заступлением Божией Матери чудесно сохранен от разрушения в пожаре 5 мая 1895 года». В 2015 году по благословению Преосвященнейшего Иоанна, епископа Брестского и Кобринского была проведена реставрация чтимого образа.
В приходе также особо почитается святитель Митрофан Воронежский, так как ранее в храме был придел в честь этого святого. 29 апреля 1987 года иконостас из придела святителя Митрофана, епископа Воронежского был демонтирован и передан в восстанавливающийся после пожара храм святой великомученицы Параскевы Пятницы в агрогородке Чернавчицы Брестского района.
С 2003 года при храме действует воскресная школа и приходская библиотека. В 2008 году организовано молодежное братство в честь святых мучениц Веры, Надежды, Любови и матери их Софии, в 2011 году – сестричество во имя святителя Иоанна Максимовича, архиепископа Шанхайского и Сан-Францисского.
Храм святых апостолов Петра и Павла (1779 г.) внесен в список историко-культурных ценностей Республики Беларусь.
Престольный праздник – 12 июля (день памяти святых первоверховных апостолов Петра и Павла).
Также особо празднуется 18 мая (день празднования Ружанской иконы Божией Матери).
В состав прихода входят населенные пункты: Байки, Власовичи, Воля, Заполье, Караси, Куляны, Манчики, Молочки, Павлово, Полонск, Шейпичи.